工学院大学附属高中综合科学课程以攻克日本大学医学部、齿学部以及难关理工大学为目标，实行特色理科教育。课程安排在高二下学期完成整个高中教学计划，高三学年进行难关大学入学考试问题练习，并且根据学生的志愿学习更专业的医学及科学知识，积累知识储备应对大学考试。
除专业授课外，也设有非常多的社会实践活动，聘请优秀的医生、学者进行演讲活动，与海外医科大学合作，让学生们了解世界医疗动向，培养自身实力。此外，学生们可以最大限度地利用工学院大学的教学资源，大学教师也会对同学们进行指导。
工学院大学附属高中与众多日本大学合作，开展“高大联合”活动，同学们可以定期访问日本诸多大学，使用大学实验室，参与到大学学长的科学项目中。工学院大学附属高中综合科学课程以培养优秀的医生及科学家为己任，努力为同学们创造出最优的学习环境。
